《表4 罗布麻Unigene中SSR位点的信息》

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《药用植物罗布麻的转录组测序及分析》

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利用MISA软件对组装得到的Unigene进行微卫星检测，共检测到13 524个SSR位点，复合形式的SSR（2个SSR位点之间的距离最大为100 bp）数目为1 365，其中3 249个Unigene含有一个以上的SSR位点。罗布麻转录组SSR类型中单核苷酸至六核苷酸重复类型均存在，但不同类型比例差异较大。单核苷酸重复最多（4 101，30.32%）；其次是三-核苷酸重复（3 200，23.66%）、二-核苷酸重复基元（3 107，22.97%）和四-核苷酸重复类型（1 743，12.89%）；五和六-核苷酸重复类型较少，分别为580个和523个，二者仅占总SSR位点的8.16%（表4）。在单核苷酸重复类别中，A/T的重复数量最多（3 644）。在二核苷酸中，AG/CT和AT/AT出现的频率较高，分别为1 843和788。AAG/CTT为三核苷酸类型中的主要重复类型。其余四核苷酸、五核苷酸、六核苷酸优势的重复类型分别为AAAG/CTTT、AAAAG/CTTTT、AAAAAG/CTTTTT（表4）。在所有的SSR类型中，4次串联重复的SSR位点最多，为2 599个；其次为3次重复的SSR位点，有2 508个；5次重复的SSR位点，数目为2 096个；以及10次重复的SSR位点，数目为1 867个（图4）。