《表1 冬虫夏草unigene序列中SSR分析结果统计》

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《冬虫夏草转录组SSR位点信息分析研究》


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高通量转录组测序共获得16 875条unigene,序列总长度为65 983 518 bp。所有unigene经MISA软件检索,共发现5 899个SSR位点,包括5 421个完美型SSR和228个复合型SSR,分布在4 252条unigene中,并且含超过1个SSR位点的unigene序列数目有1 144条,250条含复合型SSR。SSR发生频率为25.22%,出现频率为34.99%,且平均每7 952bp就出现1个SSR位点,见表1。