《表1 光皮树叶片转录组Unigene SSR搜索》
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《木本油料植物光皮树SSR特征分析及其SSR-PCR反应体系优化》
采用软件MISA(1.0版),对光皮树叶片的36839条Unigene进行SSR搜索,发现有8 945条Unigene有SSR (表1),占总数的24.3%。共检测到SSR位点12 538个,出现频率约为2 514 bp/个。其中含有2个及2个以上SSR位点的Unigene有1 576条,化合物形成中存在SSR的Unigene有1 711条,复合SSR两个位点之间,最远碱基间隔数为100。SSR长度范围在10~329 bp,平均长度为22.69 bp。SSR位点中,完整型和混合型位点个数为11 050和1 488,分别占总数的88.13%和11.87%。其中一条Unigene中含有5、4、3、2、1个SSR位点的分别有11、37、199、1 329、8 540条(图3)。SSR丰富度依次为二、一、三、四、六、五核苷酸,分别为7 282、3 388、1 675、96、59、38个SSR (图3)。
图表编号 | XD00194387300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.28 |
作者 | 周宵、彭映辉、蒋丽娟、陈景震、王明怀、何祯祥、陈勇、康向阳、张良波 |
绘制单位 | 中南林业科技大学生命科学与技术学院、湖南省林业科学院生物能源研究所、中南林业科技大学生命科学与技术学院、中南林业科技大学生命科学与技术学院、湖南省林业科学院生物能源研究所、广东省林业科学研究院、南京大学生命科学学院、重庆市大足区西山林场、北京林业大学生物科学与技术学院、湖南省林业科学院生物能源研究所、北京林业大学生物科学与技术学院 |
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