《表3 火龙果转录组Unigene的KEGG分类》

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《红肉火龙果(Hylocereus polyrhizus)果实与茎转录组测序分析》


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根据KEGG代谢途径分类,共计11 027个Unigene被聚类到5大类(表3)。代谢(5 021个)是最大的一类,其次是遗传信息处理(2 374个)。代谢类中包括含有最多Unigene的途径是碳水化合物代谢(1065个)。其他代谢途径也包括氨基酸代谢(597个)、能量代谢(581个)、脂类代谢(550个)、核苷酸代谢(301个)、辅因子与维生素代谢(298个)、其他次生代谢物代谢(249个)、其他氨基酸代谢(248个)、萜类与多聚酮代谢(230个)、多聚糖合成与代谢(137个)。进一步对氨基酸代谢、次生代谢物代谢和碳水化合物代谢详细分类(表4)。在氨基酸代谢中,半胱氨酸和蛋氨酸代谢Unigene数量最多(112个)、其次是丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢(100个)和甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢(98个),缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解(79个),酪氨酸代谢也发现含有46个Unigene。在次生代谢物代谢中,苯丙烷代谢含有Unigene数量最多(132个),其次是类黄酮合成(26个),甜菜苷合成也发现4个Unigene。在碳水化合物代谢中,淀粉和蔗糖代谢含有Unigene数量最多(239个),其次是醣酵解糖异生(222个)。柠檬酸循环、果糖和甘露糖代谢、维生素C代谢也分别发现121、112和70个Unigene。