《表3 Unigene的KEGG分类》

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《基于PacBio平台的紫娟茶树全长转录组分析》


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KEGG数据库整合了大量的基因组、生化系统以及化学分子等相关数据,包括代谢途径、疾病、药物、基因序列、功能模型以及基因组等,可完成新测序物种的基因组或转录组的功能注释。紫娟转录组有109 748个得到了注释,根据参与的KEGG代谢通路分为3个层次。第1层次分为4大类,第2层为23小类(表3),第3层次为216个代谢途径分支。涉及参与茶叶品质形成相关的代谢途径,包括氨基酸代谢的7 731个、类黄酮生物合成的有644个、单萜的合成的有57个、萜类化合物骨架生物合成487个、黄酮和黄酮醇的生物合成的有88个、花青素合成1个。涉及信号转导的有14 629个,其中MAPK信号途径有2 674个、植物激素信号转导有1 311个、AMPK信号途径975个、磷酸激酶信号系统894个和Ca信号途径292个等,都与调控植物在响应生物胁迫或非生物胁迫的信号转导有关。因此,这些U-nigene为今后深入开展紫娟茶滋味、香气以及抗逆等相关的功能基因研究提供基础信息。