《表2 3条假定的AbCYP80F1基因unigene转录组数字表达丰度》
用莨菪的HnCYP80F1蛋白序列在药用植物基因组学资源网站中的颠茄转录组数据库中进行blastn检索,筛选到3条序列相似性大于89%的unigenes,分别对应于Hn CYP80F1的上、中、下游3个区域,均被注释为littorine mutase/monooxygenase,且在须根中表达丰度最高,地上部分没有表达,与其他TAs合成途径基因的表达模式一致(表2)。分别在aba_locus_125005和aba_locus_57443上设计上游和下游引物,以颠茄根c DNA为模板,扩增出一条1 376 bp的片段,在此基础上用RACE技术分别获得了176 bp的5’端片段和297 bp的3’端片段,经拼接和高保真酶扩增验证后得到一条全长为1 675 bp的c DNA序列,该序列包含一段1 527 bp的编码框,预测编码508个氨基酸,另含有37 bp的5’UTR和96 bp的3’UTR。将该基因命名为AbCYP80F1,NCBI登录号为KF267456。
图表编号 | XD00159171800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.28 |
作者 | 付维、郑涛、姜育松、康健、张明生、苟光前、强玮 |
绘制单位 | 贵州大学生命科学学院、农业生物工程研究院山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室山地生态与农业生物工程协同创新中心、贵州大学生命科学学院、农业生物工程研究院山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室山地生态与农业生物工程协同创新中心、贵州大学生命科学学院、农业生物工程研究院山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室山地生态与农业生物工程协同创新中心、贵州大学生命科学学院、农业生物工程研究院山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室山地生态与农业生物工程协同创新中心、贵州大学生命科学学院、农业生物工程研究 |
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