《表3 AbCYP80F1基因启动子中顺式作用元件》
采用热不对称PCR(TAIL-PCR)技术对AbCYP80F1基因进行5’端染色体步移(Genome Walking),扩增AbCYP80F1基因启动子序列。3轮TAIL-PCR分别获得了559、421、2 544 bp的侧翼片段,经拼接后得到了一条3 059 bp的启动子序列,选取转录起始位点上游2 000 bp进行顺式作用元件分析,结果见图4和表3。AbCYP80F1基因启动子上游包含保守的TATA-box(-35区)和CAAT-box(-155区),除了这2个真核生物基因转录最基本的元件以外,还包括一些信号响应元件和转录因子识别结合元件。涉及的信号包括光(2个AE-box、3个Box 4、2个G-box、1个GT1-motif和1个TCT-motif)、无氧(1个ARE)、生长素(1个AuxRR-core)、茉莉酸(1个CGTCA-motif)、赤霉素(1个GARE-motif)和低温(3个LTR)。相关的顺式作用元件对应的转录因子有MYB(1个MBS和1个Myb-binding site)、AP2/ERF(4个RAV1AAT)、WRKY(3个W-box),尤其值得注意的是有11个bHLH转录因子识别的E-box元件。此外,还有1个分生组织表达相关的CAT-box和1个光敏色素下调表达相关的Unnamed-1元件。
图表编号 | XD00159171600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.28 |
作者 | 付维、郑涛、姜育松、康健、张明生、苟光前、强玮 |
绘制单位 | 贵州大学生命科学学院、农业生物工程研究院山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室山地生态与农业生物工程协同创新中心、贵州大学生命科学学院、农业生物工程研究院山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室山地生态与农业生物工程协同创新中心、贵州大学生命科学学院、农业生物工程研究院山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室山地生态与农业生物工程协同创新中心、贵州大学生命科学学院、农业生物工程研究院山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室山地生态与农业生物工程协同创新中心、贵州大学生命科学学院、农业生物工程研究 |
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