《表1 IbSSI基因启动子主要顺式作用元件》

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《甘薯IbSSI基因启动子序列的克隆及瞬时表达分析》

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注:括号内负号表示该顺式作用元件位于互补链

在之前克隆到的IbSSI基因组全长序列的基础上设计反向引物，使用Clonetech公司的GenomeWalker Universal Kit试剂盒扩增到IbSSI基因上游1 811 bp的启动子序列（图1），包括1 685 bp的5'侧翼序列和126 bp的5'端非翻译区。将该序列提交PlantCARE网站进行启动子顺式作用元件分析表明：IbSSI启动子包含多个典型的TATA-box和CAAT-box以及转录增强元件如GT-rich motif、5'UTR Pyrich stretch；1个蔗糖响应元件（CMSRE-1）和1个昼夜节律响应元件（Circadian response element）；逆境响应元件如LTRE和ARE-box；若干激素响应元件如GARE-motif、ERE、CGTCA-motif；以及光响应元件如G-box等（表1）。蔗糖响应元件及昼夜节律响应元件的存在解释了IbSSI基因受蔗糖诱导表达和昼夜节律调控的可能原因，而其它顺式作用元件的存在说明IbSSI基因的表达可能受到逆境、激素及光照等外界因素的影响并直接或间接参与甘薯对这些外界因素的响应。