《表1 Mi TFL1-4启动子中顺式元件分析》
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《芒果MiTFL1-4基因启动子克隆与生物信息学分析》
通过PCR得到1 800 bp左右、位于Mi TFL1-4基因ATG起始密码子上游的序列,利用在线分析软件NEW PLACE和Plant CARE对克隆获得的Mi TFL1-4基因启动子中可能存在的顺式作用元件的功能、数量进行分析。根据分析结果可知(表1),5个芒果品种的启动子序列中包含大量的TATA-box和CA-AT-box元件,但不同品种间的元件数量和位点有所差异,比如‘四季蜜芒’有20个TATA-box元件,第一个起始位点在-102 bp。‘台农一号’芒有20个TATA-box元件,第一个起始位点在-101 bp。‘南逗迈’有20个TATA-box元件,第一个起始位点在-101 bp。‘金煌’有20个TATA-box元件,第一个起始位点在-101 bp。‘凯特’有19个TATA-box元件,第一个起始位点在-101 bp。除此之外,Mi TFL1-4基因启动子序列上还包括多个光响应元件、激素响应元件、AGL15结合元件、MYC结合元件、MYB结合元件、低温响应元件和盐诱导元件等。但不同芒果品种间存在差异,如‘南逗迈’、‘金煌’比其他品种多两个脱落酸响应元件(即ABRE)和一个光响应元件IBOXCORE,少两个MYB结合元件、一个光敏元件REALPHALGLHCB21、两个水杨酸结合元件WBOX-ATNPR1和一个赤霉素结合元件WRKY71OS。而没有生长素响应元件CATATGGMSAUR、低温响应元件LTRE1HVBLT49、光响应元件Sp1、MYC结合元件MYCATRD22、AGL15结合元件CARGCW8-GAT (图5)。
图表编号 | XD00189156500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.14 |
作者 | 王逸涵、罗聪、余海霞、莫啸、范志毅、谢小杰、刘源、何新华 |
绘制单位 | 广西大学农学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、广西大学农学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、广西大学农学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、广西大学农学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、广西大学农学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、广西大学农学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、广西大学农学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、广西大学农学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室 |
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