《表3 半夏转录组unigenes不同数据库注释结果》

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《聚乙二醇模拟干旱胁迫下半夏茎段转录组分析》

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将所有组装得到的unigene序列分别与Nr、egg NOG、Swiss-Prot、Pfam、KOG、KEGG、GO、COG等数据库进行比对，得到unigene对应的基因、蛋白功能注释和分类信息，最终获得41 132个有注释信息的unigenes，占所组装unigenes的41.02%。Nr数据库注释到的unigenes数量最多，为39 365条，占全部unigenes的39.26%；其中4 379条unigenes序列与棕榈科植物油棕Elaeis guineensis Jacq.的基因序列高度同源，占总数的11.14%（图1）。KOG数据库注释得到24 466条unigenes，占所有unigenes的24.40%，其中注释到一般功能预测（general function prediction only），转录后修饰、蛋白质折叠、分子伴侣（posttranslational modification，protein turnover，chaperones）和信号转导机制（signal transduction mechanisms）的unigenes数量最多，分别为6 821条（25.34%）、2 635条（9.79%）、2 204条（8.19%）（图2）。KEGG数据库注释到16 381条unigenes，占总数的16.34%；能够注释到COG数据库的unigenes最少，数量为11 203条，占总数的11.17%（表3）。