《表3 三叉苦转录组unigenes次生代谢KEGG通路注释统计》

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《基于高通量测序技术的三叉苦幼苗转录组数据分析》


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三叉苦转录组中总共有17 418条unigenes成功注释到KEGG数据库中,三叉苦转录组unigenes注释到KEGG数据库的通路中共分为5类,分别是遗传信息处理、代谢、细胞过程、生物系统和环境信息处理,分别为4 613、9 619、926、460、586条。其中代谢涉及的通路最多,遗传信息处理次之,有机系统涉及的通路最少,根据KEGG数据库的注释信息能进一步得到unigenes的通路注释。根据注释结果显示,有9 807条unigenes注释到130条代谢通路中,以选取通路包含unigenes数量大于300条为标准,将基因注释数量从大到小依次排列,本文获得前14个代谢通路信息(表2)。KEGG代谢通路分析发现有830条unigenes参与三叉苦苯丙素、萜类、黄酮类、生物碱类等生物合成相关的19个次生代谢标准通路(表3)。其中,苯丙素生物合成代谢通路基因数量最多,为224条,萜类骨架生物合成代谢通路基因数量次之,为105条,类黄酮生物合成代谢通路基因数量居第3为66条,另外分别有10、7条基因与黄酮和黄酮醇、异黄酮的生物合成代谢通路相关,对苯二甲酸、哌啶和吡啶生物碱的生物合成代谢通路基因数量有49条,异喹啉、吖啶酮生物碱合成相关的基因数分别有39和1条,有41条unigenes参与二萜生物合成代谢通路,36条unigenes参与倍半萜和三萜生物合成代谢通路。