《表3 注释的差异表达基因Unigene数量》

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《青稞响应燕麦镰孢菌侵染的转录组分析》


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使用BLAST软件与COG、GO、KEGG、KOG、NCBI-NR、Pfam、Swiss-Prot和eggNOG数据库比对,共计28 869条Unigene获得注释信息(表3)。抗病青稞NQK-01-03和感病青稞甘青2号之间在接菌前、接菌20d和40dNCBI-NR数据库中注释到的Unigene最多,达到3 981条,占全部注释基因的13.79%;其次是Pfam、GO和Swiss-Prot,分别为2 946,2 931和2 672条,占全部注释基因的10.20%、10.15%和9.26%;而eggNOG数据库注释到的Unigene最少,为447条,仅占全部注释基因的1.55%。与接菌前和接菌40d相比,抗病青稞NQK-01-03和感病青稞甘青2号之间在接菌20d各数据库注释到的Unigene差异表达基因数量最多,达到2 728条。