《表3 KEGG功能注释中差异表达基因的通路和数量》
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《紫花报春苣苔差异表达基因分析及离子转运蛋白基因挖掘》
对紫花报春苣苔Unigene表达量进行分析,以石灰土中紫花报春苣苔叶片Unigene表达量作为参照,与红壤中紫花报春苣苔叶片Unigene的表达量进行比较,差异表达的Unigene共有656个,其中324个Unigene上调表达,332个Unigene下调表达。对紫花报春苣苔差异表达基因进行GO及KEGG功能富集分析,但GO功能富集分析没有得到显著的富集结果,而KEGG的功能富集分析结果表明,共有231个差异表达基因分别被富集到了77条KEGG的Pathway中,不同的代谢路径中差异表达基因数的范围分别为1~9,叶片中差异表达基因注释序列最多的10条代谢通路所含的差异表达基因有68个,所占比例约为富集分析差异表达基因总数的30%,具体的代谢通路包括内质网中的蛋白质加工(ko04-141)、核糖体(ko03010)、光合作用(ko00195)、甘油磷脂新陈代谢(ko00564)、植物激素信号转导(ko04075)、丙酮酸代谢(ko00620)、真核生物的核糖体生物起源(ko03008)、氧化磷酸化(ko00190)、氨基糖和核苷酸糖代谢(ko00520)、植物-病原互作(ko04626)(表3)。KEGG富集分析结果发现,两种土壤中紫花报春苣苔差异表达基因的功能主要与物质代谢、光合作用、激素信号传导以及生物胁迫有关。
图表编号 | XD00131408000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.28 |
作者 | 刘合霞、李博 |
绘制单位 | 玉林师范学院生物与制药学院、桂林师范高等专科学校 |
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