《表5 火龙果果实和茎Unigene的FPKM值》

《表5 火龙果果实和茎Unigene的FPKM值》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《红肉火龙果(Hylocereus polyrhizus)果实与茎转录组测序分析》


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将果肉和茎文库中测序获得的Clean read比对到拼接获得的Unigene,以进一步计算Unigene在果肉和茎中的基因表达丰度。果肉和茎分别有83.83%和86.25%的Clean read比对到Unigene上。对各个Unigene计算FPKM值,然后统计其分布情况(表5)。果肉和茎中的Unigene的FPKM值分布趋势基本一致。大部分Unigene的FPKM值(分别为57.91%和59.38%)分布于0~1;分布在1~5的Unigene分别有28.62%和27.34%,分布在5~10的Unigene分别有7.82%和7.58%,分布在10~100的Unigene分别有5.45%和5.39%,≥100的Unigene分别有0.21%和0.31%。