《表3 火龙果转录组单核苷酸重复至六核苷酸重复的类型及发生频率》
由表3看出,在火龙果转录组中共检测到189种重复单元,单核苷酸重复至六核苷酸重复单元的类型分别为4种、12种、60种、73种、16种和24种,单核苷酸重复至三核苷酸重复单元的数量占所有SSR类型总量的99.04%。从SSR的发生频率看,在单核苷酸重复中,A/T类型的发生频率最高,为7.73%,其数量占SSR总量的37.26%;C/G类型其次,占比为4.63%,其数量占SSR总量的22.31%。在二核苷酸重复中,AC/GT、AG/CT和AT/AT是主要的二核苷酸重复类型。其中,以AG/CT类型的发生频率最高,为4.68%,其数量占SSR总量的22.57%;AC/GT类型其次,为0.61%,占比为2.93%;CG/CG类型最少,为0.01%,占比为0.05%。在三核苷酸重复中,以AAG/CTT类型的发生频率最高,为0.66%,其数量占SSR总量的3.17%;ATC/ATG类型其次,为0.53%,占比为2.55%。四核苷酸至六核苷酸重复出现的频率均较低,分别为0.71%、0.10%和0.15%。
图表编号 | XD0019160600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.07.15 |
作者 | 王壮、郑乾明、成文韬、毛永亚、蔡永强、马玉华 |
绘制单位 | 贵州省农业科学院果树科学研究所、贵州省农业科学院果树科学研究所、贵州省农业科学院果树科学研究所、贵州省农业科学院果树科学研究所、贵州省农业科学院果树科学研究所、贵州省农业科学院果树科学研究所 |
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