《表1 紫海杂交扇贝各核苷酸重复类型出现频率统计》
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《紫扇贝与海湾扇贝杂交一代EST-SSR分析及分子标记开发》
对来自紫海杂交扇贝的306 643条EST进行了SSR搜索,共42 868EST序列包含SSR,占总数的13.98%。由表1可以看出,紫海杂交扇贝EST-SSR种类较为丰富,一至六核苷酸重复类型都能看到,但各种类型的出现频率差异较大,且以1~2核苷酸重复基元为主,占总EST-SSR的92.75%。在所有的重复基元类型中含有单核苷酸重复类型的SSR数量最多为29 593,占总SSR的69.03%,出现频率为9.65%;其次是二核苷酸重复类型,数量为10 170,占总SSR的23.72%,出现频率为3.32%;接着是三核苷酸重复类型,数量为2 571,占总SSR的6%,出现频率为0.84%;然后是四核苷酸重复类型,数量为527,占总SSR的为1.23%,出现频率为0.17%;五核苷酸和六核苷酸重复类型最少,分别占总SSR的0.01%、0.01%,因出现频率太低,此处不再赘述。
图表编号 | XD0070473200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.09.01 |
作者 | 陈银、刘博、徐冬雪、林基亮、曹为安、王春德 |
绘制单位 | 青岛农业大学海洋科学与工程学院、青岛农业大学海洋科学与工程学院、青岛农业大学海洋科学与工程学院、青岛农业大学海洋科学与工程学院、青岛农业大学海洋科学与工程学院、青岛农业大学海洋科学与工程学院 |
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