《表2 所有Unigene与所有公开数据库的注释》
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《红肉火龙果(Hylocereus polyrhizus)果实与茎转录组测序分析》
通过BLAST或HMMER程序,对获得的Unigene与NCBI非冗余蛋白数据库(NR),NCBI核酸数据库(NT),Swiss-Prot蛋白数据库,KEGG数据库,COG数据库,Protein family(Pfam)和GO数据库进行比对。结果表明,28 997个(36.40%)的Unigene能够比对到NR数据库,18 603个(23.35%)比对到NT数据库,21 997个(27.61%)比对到SwissProt数据库。共计有35 139个(44.11%)Unigene能够在所有的数据库中被注释。在NR数据库注释到的匹配物种中,甜菜Unigene最多(18 067个),其次为葡萄(18 067个),荷花(18 067个),棉花(18 067个),番木瓜(18 067个)和甜橙(18 067个)(表2) 。
图表编号 | XD0031209800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.14 |
作者 | 郑乾明、王壮、蔡永强、马玉华 |
绘制单位 | 贵州省农业科学院果树科学研究所、贵州省农业科学院果树科学研究所、贵州省农业科学院果树科学研究所、贵州省农业科学院果树科学研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |