《表2 张溪香芋Unigene注释率统计》
通过与9大生物信息学数据库进行比对分析,得到张溪香芋转录组中基因功能、代谢通路和转录因子等,共有23 628条(50.66%) Unigenes获得信息注释,其中1 949条(4.18%)在所有数据库种均能获得注释。NR、Tr EMBL、Swissprot、GO、CDD 5个数据库中能注释的张溪香芋Unigene数目在30%以上。其中在NR和Tr EMBL中注释成功的Unigene数目较多,有23 174条和22 940条,分别占总Unigene数的49.69%和49.19%;19 526条(41.87%) Unigenes在GO中注释,17 462条(37.44%) Unigenes在Swissprot中得到相应的蛋白质信息(表2)。结果表明,张溪香芋转录组获得的注释数据可以用于开展后续相应分析。
图表编号 | XD00196569100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.25 |
作者 | 王继华、罗群胜、梅瑜、杨少海 |
绘制单位 | 广东省农业科学院作物研究所、乐昌市农业科学研究所、广东省农业科学院作物研究所、广东省农业科学院作物研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |