《表1 薄壳山核桃转录组SSR位点的信息》

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《薄壳山核桃转录组中的SSR位点信息分析》


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薄壳山核桃转录序列总长度为41.86 Mb,雌花序转录组拼接获得53 894个非冗余基因(Unigene),雄花序转录组获得53 897个Unigene,其中,绝大多数Unigene的G+C含量为30%~60%,Unigene的平均长度是776.69 bp,N50为1 411 bp。搜索53 894个Unigene发现,有9 871个Unigene含有10 303个SSR位点,发生频率为18.31%;其中,8 259个Unigene只含有1个SSR位点,1 612个Unigene含有2个以上(含2个)SSR位点,SSR位点出现的频率是21.92%(表1)。