《表1 波纹唇鱼转录组部分SSR信息》

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《基于转录组测序的波纹唇鱼SSR和SNP多态特征分析》

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利用MISA软件，对波纹唇鱼转录组150 218条Unigene序列中的SSR位点进行查找，共获得22 428个位点，分布于18957条Unigene上，包含复合型693个（表1）。在2 767条Unigene中含有1个以上的SSR位点，SSR的发生频率与出现频率分别为12.62%和14.93%。根据Unigene的总长度计算，波纹唇鱼SSR的分布密度为0.187 SSR/kb，即平均约每5.35 kb会出现1个SSR位点。全部SSR序列总长度为333.602 kb，占Unigene总长度的0.28%。