《表4 波纹唇鱼转录组SNP类型,数量及比例》
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《基于转录组测序的波纹唇鱼SSR和SNP多态特征分析》
从波纹唇鱼转录组Unigene中共发现245 373个SNP位点(表4)。发生频率为1/490 bp,即平均每490 bp核酸片段就有1个SNP位点,这些SNP位点中碱基转换位点162 267个,碱基颠换位点83 106个。6种单核苷酸变异类型中,A/G的发生频率最高,占SNP位点总数的33.61%;其次是C/T,占总数的32.51%;其他4种颠换类型A/T、A/C、T/G、C/G分别占SNP位点总数的11.12%、8.30%、8.59%和5.86%。由此可见,碱基转换类型的比例显著高于颠换类型。
图表编号 | XD00147622200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.25 |
作者 | 刘洪涛、刘金叶、杨明秋、何玉贵、王永波 |
绘制单位 | 海南省海洋与渔业科学院、海南省海洋与渔业科学院、海南省海洋与渔业科学院海南省热带海水养殖技术重点实验室、海南省海洋与渔业科学院海南省热带海水养殖工程技术研究中心、海南省海洋与渔业科学院 |
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