《表2 杂交鳢转录组SNP位点的分类》

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《基于高通量测序的杂交鳢转录组数据分析》


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以转录组作为参考序列,利用Bwa和Samtools对杂交鳢的外显子区域进行SNP位点发掘,总共得到37 324个SNP位点,包括A–G、C–T、A–C、A–T、C–G和G–T共6种类型的SNP(表2)。在所有类型的SNP中,A–G和C–T所占比例较高,两者总计占所有SNP位点的57.75%;剩下的4种SNP类型A–C、A–T、C–G和G–T所占比例相近,四者总计占总数的42.25%。