《表5 BLANK、LPS-4h、LPS-8h转录组特异分布免疫防御相关基因SNP位点分析(仅展示前10行)》

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《基于转录组测序的方斑东风螺单核苷酸多态性位点挖掘及功能注释》

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根据转录组中unigene的SNP位点分布情况及KEGG功能注释信息筛选BLANK、LPS-4h、LPS-8h转录组中特异分布的免疫防御相关基因SNP位点，发现大量的SNP位点存在于免疫防御相关基因中（表5）。基于RPKM标准化分析unigene的表达水平，筛选阈值为q<0.05，且|log2（差异倍数）|>1，获得大量差异表达基因。统计这些差异表达基因上的SNP位点，并对其中涉及免疫防御的基因进行KEGG通路分析。注射LPS 4 h后，差异表达的免疫防御相关基因主要参与胞吞作用、IL-17信号通路、mTOR信号通路、Wnt信号通路。注射LPS 8h后，存在大量SNP位点的免疫相关基因主要参与吞噬体、溶酶体通路。比较注射4 h与8 h，免疫相关基因则主要参与基座切除修复、谷胱甘肽代谢、药物代谢（细胞色素P450）、细胞色素代谢通路（表5）。