《表2 差异SNP与转录组数据的关联分析Table 2 Correlation analysis between differential SNP and transcriptional data》下

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《马铃薯全基因组重测序和转录组的关联分析》

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在CV分析后，共有428个候选转录本（315个基因）与转录组数据进行了关联分析（表2），其中共有221个基因在土豆中具有表达，共有35个（15.8%）转录本是显著差异的（FDR<0.05），共有107个（48.4%）转录本倍性变化≥2倍（HAP相对于LAP 39个上调，68个下调）。从221个候选基因的密度曲线（图2）中，我们发现部分基因具有非常高的表达差异。其中PG-SC0003DMT400046204（Pectinesterase （EC 3.1.1.11），果胶酯酶（EC 3.1.1.11）） 基因表达差异达到100倍（LAP相对于HAP）、PGSC0003DMT400079384（Uncharacterized protein，未知蛋白）达到94倍（LAP相对于HAP）、PGSC0003DMT400070876（Uncharacterized protein，未知蛋白）具有18.49倍（LAP相对于HAP）。