《表1 差异indel与转录组数据关联分析Table 1 Correlation analysis between differential indel and transcriptional dat

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《马铃薯全基因组重测序和转录组的关联分析》

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在进行差异Indel分析后，共有830个候选转录本（726个基因）与转录组数据进行了关联分析（表1），其中共有346个基因在土豆中具有表达，共有54个（15.6%）转录本是显著差异的（FDR<0.05），共有219个（63.2%）转录本倍性变化≥2倍（HAP相对于LAP83个上调，136个下调）。从221个候选基因的密度曲线中（图1），我们发现部分基因具有非常高的表达差异。其中PGSC0003DMT400018274（Uncharacterized protein，未知蛋白）基因表达差异达到81倍（LAP相对于HAP）、PGSC0003DMT400058739（Uncharacterized protein，未知蛋白）达到77倍（LAP相对于HAP）、PGSC0003DMT400075475（Unch aracterized protein，未知蛋白）具有71.40倍（LAP相对于HAP）。