《表3 杂交鳢转录组功能注释》
分别在6个数据库中对组装得到的52 065条unigenes进行注释(表3)。不同数据库中注释成功的unigene基因数及其所占比例有所差别。有10 215条unigenes同时在6个数据库中注释成功,占总数的19.62%;在这6个数据库中至少有1个数据库注释成功的有30 398条,占总数的58.38%;在Nr非冗余数据库中成功注释的unigenes数最多,共有28 938条,占55.58%,推测这可能与序列相似性比对搜索相关。按物种注释分布统计,得到注释unigenes数最多的是双色雀鲷(Stegastes partitus),占35.3%,而这与两者都属于鲈形目鱼类是一致的;注释到尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)的unigenes数占14.1%;斑马拟丽鱼(Maylandia zebra)、布氏新亮丽鲷(Neolamprologus brichardi)、伯氏朴丽鱼(Haplochromis burtoni)和慈鲷鱼(Pundamilia nyererei)的unigenes数分别占7.2%、5.2%、5.2%和4.8%;而注释到其他物种的unigenes占28.3%,推测可能是新的基因。
图表编号 | XD00101770300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.10.25 |
作者 | 黄勇、龚望宝、陈海刚、孙西红 |
绘制单位 | 河南科技大学动物科技学院、中国水产科学研究院珠江水产研究所、中国水产科学研究院南海水产研究所、广东省渔业生态环境重点实验室、河南科技大学动物科技学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |