《表2 松萝凤梨转录组功能注释》

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《松萝凤梨转录组测序分析》


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分别将Unigene注释到Nr、Nt、SwissProt、Pfam、GO、KOG和KEGG数据库中,并分别对注释到每个库以及所有注释上的Unigene数目进行分析统计(表2)。通过Blast搜索比对,获得注释的Unigenes有34 419条,占总Unigenes的54.82%,其中1 890条Unigenes在所有的数据库中得到了注释。Nr数据库比对注释的信息最多,注释了34 436条Unigenes;KO注释的信息最少,仅5 574条Unigenes得到了注释。注释结果表明,一些Unigenes与根相关。在Nr库中,7个Unigenes与根相关,功能注释到的匹配物种中涉及二穗短柄草、玉米、蓖麻和葡萄。在Nt库中,10个Unigenes与根相关,功能注释到的匹配物种中涉及二穗短柄草、番茄、山荆子。SwissProt库中,13个Unigenes与根相关,功能注释到的匹配物种中涉及拟南芥、水稻、大豆、玉米(表3)。