《表2 松萝凤梨转录组功能注释》
分别将Unigene注释到Nr、Nt、SwissProt、Pfam、GO、KOG和KEGG数据库中,并分别对注释到每个库以及所有注释上的Unigene数目进行分析统计(表2)。通过Blast搜索比对,获得注释的Unigenes有34 419条,占总Unigenes的54.82%,其中1 890条Unigenes在所有的数据库中得到了注释。Nr数据库比对注释的信息最多,注释了34 436条Unigenes;KO注释的信息最少,仅5 574条Unigenes得到了注释。注释结果表明,一些Unigenes与根相关。在Nr库中,7个Unigenes与根相关,功能注释到的匹配物种中涉及二穗短柄草、玉米、蓖麻和葡萄。在Nt库中,10个Unigenes与根相关,功能注释到的匹配物种中涉及二穗短柄草、番茄、山荆子。SwissProt库中,13个Unigenes与根相关,功能注释到的匹配物种中涉及拟南芥、水稻、大豆、玉米(表3)。
图表编号 | XD0058989600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.06.14 |
作者 | 金亮、田丹青、詹书侠、安霞、葛亚英、王炜勇 |
绘制单位 | 浙江省农业科学院花卉研究开发中心国家花卉工程技术研究中心凤梨研发与推广中心、浙江省农业科学院花卉研究开发中心国家花卉工程技术研究中心凤梨研发与推广中心、浙江省农业科学院花卉研究开发中心国家花卉工程技术研究中心凤梨研发与推广中心、浙江省农业科学院花卉研究开发中心国家花卉工程技术研究中心凤梨研发与推广中心、浙江省农业科学院花卉研究开发中心国家花卉工程技术研究中心凤梨研发与推广中心、浙江省农业科学院花卉研究开发中心国家花卉工程技术研究中心凤梨研发与推广中心 |
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