《表5 湖北麦冬、川麦冬及杭麦冬叶绿体基因组的SSR类型、数量及比例》

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《湖北麦冬、川麦冬及杭麦冬叶绿体基因组分析》

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在湖北麦冬叶绿体基因组中共搜索到274个SSR位点，其中单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸重复分别有139，45，80，8，2个。重复最多的是单核苷酸重复，且主要是A/T的重复，共有51处连续A和80处连续T的单核苷酸重复，占所有单核苷酸重复（139个）的94.2%；之后依次为AAT/ATT（28次），AT/AT（27次），AAG/CTT（21次），AG/CT（17次）和AAC/GTT（12次），这些重复序列占总数的86.1%。在川麦冬叶绿体基因组中共发现265个符合条件的SSR位点，重复最多的是单核苷酸重复，且主要是A/T的重复，共有46处连续A和72处连续T的单核苷酸重复，占所有单核苷酸重复（123个）的95.9%。在杭麦冬叶绿体基因组中共发现274个符合条件的SSR位点，重复最多的也是单核苷酸重复，且主要是A/T的重复，共有51处连续A和80处连续T的单核苷酸重复，占所有单核苷酸重复（139个）的94.2%。另外，3条序列的单核苷酸至三核苷酸重复序列的碱基组成均存在一定的碱基偏好性，以富含AT的重复序列为主。这与湖北麦冬、川麦冬及杭麦冬叶绿体基因组富含AT（AT质量分数分别为62.3%，61.9%及62.3%）一致。这种偏好性可能与AT比GC更容易突变有关。见表5。