《表4 文冠果果实转录组SSR分布特征》

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《文冠果果实转录组测序及分析》


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利用MISA软件对筛选得到的1 kb以上的Unigene做SSR分析,结果如表4所示:共发现SSR位点11 732个。其中,单核苷酸SSR最丰富,有7 139个,远远超过其他种类SSR,占全部SSR的60.85%,平均长度最短,为12.46 bp;二核苷酸SSR(2 655个)和三核苷酸SSR(1 854个)分别占总SSR的22.63%和15.8%,平均长度分别为15.47 bp和16.53 bp;四核苷酸SSR(63)、五核苷酸SSR(11)和六核苷酸SSR(10)很少,三者之和不到总SSR的1%,其平均长度较长,六核苷酸SSR的平均长度达到43.2 bp。