《表3 乌桕转录组的SSR类型分布》

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《基于转录组序列的乌桕SSR分子标记开发》


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对检测到的SSR位点的统计显示,乌桕SSR位点的数量与其重复基元存在一定关系,即乌桕SSR位点的数量随着核苷酸重复的增加而减少(表3)。单核苷酸重复的SSR位点数量为2 946个,占比为40.11%,且重复单元以A/T为主;其次是三核苷酸重复位点的2314个,占比31.51%,重复单元以AAG/CTT为主;双核苷酸重复位点数量为1 958个,占比26.66%,重复单元是AG/CT;相比而言,以四核苷酸、六核苷酸和五核苷酸为重复基元的SSR位点数量则较小,依次为71 (0.97%)、37 (0.50%)和8 (0.25%),主要重复单元依次是AAAG/CTTT、AGAGGG/CCC TCT、AGAGG/CCTCT。