《表1 云南金花茶转录组各SSR的分布特征》

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《云南金花茶转录组SSR的分布及其序列特征》


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云南金花茶转录组中的SSR基元类型较为丰富,对云南金花茶转录组SSR的各个重复基元统计可知,重复率最高的基元类型为二核苷酸,占总数的71.44%;其次是三核苷酸,占总数的25.48%;四核苷酸到六核苷酸重复基元较低,并且四核苷酸重复基元要高于五核苷酸和六核苷酸。各重复类型SSR分布的平均距离方面,五核苷酸最高,为1 239.75 kb(每1 239.75 kb就会出现一个五核苷酸SSR);而二核苷酸的平均分布距离最低,仅为4.85 kb(每4.85 kb就会出现一个二核苷酸SSR)。统计各个重复类型SSR出现的频率发现,二核苷酸重复基元类型的出现频率最高,为14.03%;而五核苷酸重复类型的出现频率最低,仅为0.05%(表1)。