《表4 香椿中SSR基序的类型和数量》

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《香椿染色体核型分析及SSR分子标记开发》

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通过对香椿转录组测序得到的66 921条Unigene（总序列长51 295 974 bp）进行SSR位点搜索，在11 184条序列中检测到了13 324个SSR位点，SSR出现频率为19.91%，1 799条Unigene含有两个及以上的EST-SSR位点，出现频率为2.69%，平均3.84 kb出现1个SSR，其中复合型的SSR有575个。从搜索结果来看，香椿中单核苷酸至六核苷酸重复均存在，主要的重复类型为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复，分别占62.33%、19.66%和15.99%，四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复类型数量较少，分别占1.63%、0.25%和0.13%。香椿转录组SSR重复单元的重复次数在5～33次之间，其中5～10次重复的SSR有8 137个，占总数的61.07%；11～20次重复的SSR有5 051个，占总数的37.91%；>20次重复的SSR有136个，只占总数的1.02%（表4）。