《表1 在线软件GenomeNet对OsUF基序的分析》

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《水稻OsUF的基序分析及其亚细胞定位》


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应用GenomeNet软件对OsUF motif进行分析得到7个motif(图1),其中包含5个与泛素化相关的motif,分别是Ubiquitin(Ubiquitin family)、Rad60-SLD(Ubiquitin-2 like Rad60 SUMO-like)、Ubiquitin-2(Ubiquitin-like domain)、Rad60-SLD-2(Ubiquitin-2 like Rad60 SUMO-like)和DUF2407(Ubiquitinlike domain)。另外还包含了其他功能的2个motif,分别是Ribosomal_L40e(PF01020,Ribosomal L40e family)和zf-C4pol(PF14260,C4-type zinc-finger DNA polymerase delta)(表1) 。其中,Ubiquitin和Ubiquitin-2(泛素化)蛋白翻译后修饰是植物生长发育和胁迫应答的关键调控机制,而类泛素化motif Rad60-SLD、Rad60-SLD-2和DUF2407主要通过共价修饰底物蛋白的赖氨酸来改变底物蛋白的稳定性、活性、亚细胞定位及结构,进而参与调控植物根、花和叶片等重要器官的发育和环境胁迫响应。