《表1 在线分析功能网站及软件》

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《花生类受体蛋白激酶Ah Al SRK的原核表达与体外活性分析》


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利用Signal P 4.0、TMHMM Server v.2.0、NCBI CD软件、SMART对蛋白质一级氨基酸序列进行分析,预测其结构域(参数:默认)。利用DNAMAN5.2.2软件比对同源多序列间共同保守区域(参数:默认)。利用MEGA7.2软件中Clustal W进行同源多序列比对,(参数:默认)。使用最小邻距离法(Neighbor-joining,NJ)构建系统进化树,Bootstrp method检验设置为500;Substitution Model选择pdistance模型;Gap/Missing Data Treatment选择Par‐tial deletion(程度为50%)。利用GOR4、SWISS-MODEL软件预测蛋白质高级结构(参数:默认)。NCBI Primer-BLAST检索完整克隆基因胞内域引物(参数:默认)。Prot Para分析重组蛋白理化性质(参数:默认)。本试验中所用到的生物信息学分析网站及软件如下(表1)。文中所涉及的蛋白质和基因氨基酸序列均来自NCBI网站。