《表1 在线网站：羊源多杀性巴氏杆菌ompW基因的克隆及生物信息学分析》

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《羊源多杀性巴氏杆菌ompW基因的克隆及生物信息学分析》

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将测序获得的目的基因输入DNAMAN 8.0软件推导氨基酸序列，并与参考菌株进行氨基酸序列比对。选取不同宿主的多杀性巴氏杆菌基因组在NCBI中进行BLAST分析，并用DNAStar 7.1软件包中的Megalign进行同源性比对分析及系统进化树构建。使用ProtPara软件进行蛋白质理化性质预测；使用Protscale软件中Kyte&Doolittle预测疏水性；使用SignalP 4.0Server软件预测信号肽；使用TMHMM Server v.2.0软件预测蛋白跨膜螺旋；使用NetNGlyc 1.0Server、NetOGlyc 3.1Server及NetPhos 2.0Server软件预测糖基化及磷酸化位点；使用ABCpred、SYFPEITHI、Net-MHCⅡpan 3.1Server软件预测细胞抗原表位；使用SOPMA软件预测蛋白质二级结构；使用SWISS-MODEL软件预测蛋白质三级结构。具体网址见表1。