《表2 利用MEME软件对柑橘CYP基序分析》

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《柑橘亲环蛋白基因家族的鉴定与生物信息学分析》


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通过MEME软件对62个CYP基因进行保守结构域分析,共得到10个保守基序(表2)。Interproscan的功能预测结果表明,每条序列平均包含4.79个motif,motif 1,motif 2,motif 4,motif 5预测到含有CLD结构域,其中包含motif 2的基因数目最多,为57个,E值为2.2e-685。剩下的6个motif并没有预测到功能,其中具有motif 6的基因最多,有31个,E值为3.2e-121,motif 10的基因数目最少,为4个,E值为3.3e-072,表明这些含有未知功能的基因可能具有重要的功能(图3)。