《表8 火龙果SSR基序重复类型统计》

《表8 火龙果SSR基序重复类型统计》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《红白果肉颜色火龙果果肉转录组分析和基因功能注释》


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从火龙果74 033个Unigene中查找到15 770个SSR位点,占Unigene总数的比例为21.30%(表6)。在火龙果转录组SSR中共发现209种重复基元,单核苷酸到六核苷酸重复类型依次有2种、4种、10种、19种、47种和127种。双核苷酸重复所占比例最高,达到39.58%(表7),其次为单核苷酸重复,为38.22%,三核苷酸重复比例为17.27%;比例最低的是四核苷酸重复,仅为1.22%,五核苷酸重复和六核苷酸重复分别为1.62%和2.10%。在检出的SSR中,出现频率最高的重复基元为AG/CT(占33.80%),其次为A/T(19.38%)、C/G(18.84%)、AAG/CTT(4.22%)、AC/GT(3.95%)、ATC/ATG(3.68%)(表8) 。