《表8 火龙果SSR基序重复类型统计》
从火龙果74 033个Unigene中查找到15 770个SSR位点,占Unigene总数的比例为21.30%(表6)。在火龙果转录组SSR中共发现209种重复基元,单核苷酸到六核苷酸重复类型依次有2种、4种、10种、19种、47种和127种。双核苷酸重复所占比例最高,达到39.58%(表7),其次为单核苷酸重复,为38.22%,三核苷酸重复比例为17.27%;比例最低的是四核苷酸重复,仅为1.22%,五核苷酸重复和六核苷酸重复分别为1.62%和2.10%。在检出的SSR中,出现频率最高的重复基元为AG/CT(占33.80%),其次为A/T(19.38%)、C/G(18.84%)、AAG/CTT(4.22%)、AC/GT(3.95%)、ATC/ATG(3.68%)(表8) 。
图表编号 | XD0031220500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.28 |
作者 | 吴亚维、徐娟、韩秀梅、张兴无、洪怡、文晓鹏 |
绘制单位 | 贵州大学生命科学院贵州大学农业生物工程研究院山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室、贵州省农科院果树科学研究所、华中农业大学园艺植物生物学教育部重点实验室、贵州省农科院果树科学研究所、贵州省农科院果树科学研究所、贵州大学生命科学院贵州大学农业生物工程研究院山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室、贵州大学生命科学院贵州大学农业生物工程研究院山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室 |
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