《表1 序列重叠群和单基因序列组装结果统计》

《表1 序列重叠群和单基因序列组装结果统计》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《红白果肉颜色火龙果果肉转录组分析和基因功能注释》


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通过组装(表1),“紫红龙”共获得了106 373条Contigs和79 768条Unigenes。其中Contig总长度为42 796 933 bp,N50长度为855 bp,平均长度为402 bp,长度100~500 bp的Contig 59 726条,占总Contig的56.15%;Unigenes总长度57 333 822 bp,N50长度1 505 bp,平均长度719 bp。在100~500 bp长度片段Unigene 49 662条,达到总Unigene的62.26%。‘晶红龙’共获得了115 775条Contigs和89 833条Unigenes。其中Contig总长度49 930 098 bp,N50长度930 bp,平均长度431 bp。长度0~500 bp的Contig60 896条,占Contig总数量的52.06%;Unigenes总长度72 206 312 bp,N50长度1 714 bp,平均长度804 bp。长度在100~500 bp的Unigene片段有53 331条,达到总Unigene的59.37%。Unigene的N50长度在1 000~2 000 bp范围内越长,组装质量越好,‘紫红龙’和‘晶红龙’组装的结果较好,可以用于后续分析和信息挖掘工作。