《表1 序列重叠群和单基因序列组装结果统计》
通过组装(表1),“紫红龙”共获得了106 373条Contigs和79 768条Unigenes。其中Contig总长度为42 796 933 bp,N50长度为855 bp,平均长度为402 bp,长度100~500 bp的Contig 59 726条,占总Contig的56.15%;Unigenes总长度57 333 822 bp,N50长度1 505 bp,平均长度719 bp。在100~500 bp长度片段Unigene 49 662条,达到总Unigene的62.26%。‘晶红龙’共获得了115 775条Contigs和89 833条Unigenes。其中Contig总长度49 930 098 bp,N50长度930 bp,平均长度431 bp。长度0~500 bp的Contig60 896条,占Contig总数量的52.06%;Unigenes总长度72 206 312 bp,N50长度1 714 bp,平均长度804 bp。长度在100~500 bp的Unigene片段有53 331条,达到总Unigene的59.37%。Unigene的N50长度在1 000~2 000 bp范围内越长,组装质量越好,‘紫红龙’和‘晶红龙’组装的结果较好,可以用于后续分析和信息挖掘工作。
图表编号 | XD0031220600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.28 |
作者 | 吴亚维、徐娟、韩秀梅、张兴无、洪怡、文晓鹏 |
绘制单位 | 贵州大学生命科学院贵州大学农业生物工程研究院山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室、贵州省农科院果树科学研究所、华中农业大学园艺植物生物学教育部重点实验室、贵州省农科院果树科学研究所、贵州省农科院果树科学研究所、贵州大学生命科学院贵州大学农业生物工程研究院山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室、贵州大学生命科学院贵州大学农业生物工程研究院山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室 |
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