《表2 序列组装拼接效果评价》

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《动物病毒宏基因组数据分析平台的建立及应用》


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利用本地化安装的组装效果评价软件对得到的重叠序列集进行评价,A为本地化建立的病毒宏基因组数据分析方法组装后得到重叠序列集的组装效果评价结果,B为经公司测序分析后得到的重叠序列集的组装效果评价结果(表2)。N50作为组装效果评价中的重要指标,其是将拼接得到的重叠序列由长到短进行排序并累加,当累加和达到重叠序列总长度的50%时,最后参与加和的那一条重叠序列即为拼接后重叠序列数据集的N50的长度。结果A与结果B的N50长度分别为1 052 bp和1 002 bp,表明二者之间在序列拼接方面无明显差异。