《表3 不同序列拼接软件的特点比较》

《表3 不同序列拼接软件的特点比较》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《全基因组测序与生物信息学分析在细菌耐药性研究中的应用》


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RAY依旧是一款基于DBG算法的程序,但其特殊之处在于依赖欧拉距离算法,这种算法定义某一特殊序列子集为种子(Seeds)并通过添加这些种子对拼接的序列进行延伸[42]。这样的延伸过程被启发法(Heuristics)或命令法(Commands)控制,将在种子与序列无交叉重叠时停止。这样拼接出来的序列长度相对较短,但是错误较少。表3列出了几种常用的序列拼接软件及其各自的特点。