《表2 不同测序平台的相关参数》
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《全基因组测序与生物信息学分析在细菌耐药性研究中的应用》
目前市场上的全基因组测序平台主要由Illumina(San Diego)、ThermoFisher(Waltham)、PacBio(Pacific Biosciences)和Oxford Nanopore Technology开发的一系列平台如Miseq、Hiseq、X Ten、Ion、PacBio RSⅡ、PacBio Sequel以及MinION等,不同平台的测序技术大相径庭,Illumina测序平台主要通过读取不同色荧光标记的可逆终止核苷酸的图像得到最终的序列结果[37];ThermoFisher测序平台主要是使用半导体芯片计算每添加一个核苷酸pH值的改变而推算得到最后的序列结果[38];PacBio测序平台主要通过纳米技术和现代光学系统对单分子合成中的碱基磷酸基团上的荧光信号进行识别,并将荧光信号转化为序列结果[39];Oxford Nanopore Technology测序平台主要通过将单分子碱基穿过纳米孔蛋白的电流信号转换为序列结果[40]。在数据产出、运行时间、序列读长等指标上不同公司的测序平台甚至同一公司不同系列的平台均存在较大的差别,可根据具体的情况选择最适合的平台(表2)。
图表编号 | XD0040388400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.04.25 |
作者 | 沈应博、史晓敏、沈建忠、汪洋、王少林 |
绘制单位 | 中国农业大学动物医学院、中国农业大学动物医学院、中国农业大学动物医学院、中国农业大学动物医学院、中国农业大学动物医学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |