《表1 主要测序平台及其特点》

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《高通量测序技术在水产品加工贮藏中的应用》

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水产品中微生物的检测最早以微生物纯培养为主，但此法仅能检测到少量丰度较高的优势菌，无法全面分析其微生物群落结构[8]。近年来，随着微生物检测技术的发展，变性梯度凝胶电泳（Denaturing Gradinent Electrophoresis，DGGE)[9]与实时定量荧光聚合酶链式反应（Real-Time Polymerase Chain Reaction，RT-PCR)[10]等技术逐渐得到应用。以上技术虽可满足部分水产品的微生物检测需求，但由于其中部分检测技术具有成本高、测序范围有限、无法检测到丰度较低的菌群、测序准确度较低、在检测过程中极易产生人为误差等缺点，在一定程度上限制了其在水产品中的深入应用。高通量测序技术（High Throughput Sequencing，HTS）属免培养分子生物学技术之一[11]。1977年，Sanger的双脱氧终止法诞生，被称为第1代测序技术；随着科技进步，第2代测序技术和第3代测序技术相继出现。目前应用最广泛的是第2代测序技术（Next-generation sequencing，NGS），其主要平台有Illumina测序平台和454焦磷酸测序平台[12]。第3代测序技术（Third generation sequencing technology，TGS）的主要平台是Pac Bio公司的单分子实时测序（Single Molecule Real Time，SMRT）平台。从第1代测序技术诞生，发展到第3代测序先后经历了测序长度由长到短、由短到长的变化[13]。主要测序平台及特点见表1[14—18]。