《表1 转录本及基因序列拼接长度分布》

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《黄麻(Corchorus capsularis L.)干旱胁迫转录组初步分析》

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本次转录组测序经去除接头以及低质量序列信息等后，共获得7.08 G高质量测序数据（Clean reads），并使用Trinity软件（Grabherr et al.，2011）对这些Clean reads进行拼接共得到45 942条转录本（Transcripts）。随后，使用Corset软件（Davidson and Oshlack，2014），利用比对上转录本的reads数和表达模式对转录本进行层次聚类，从而得到23 297个非冗余的基因（Unigenes）。对这些转录本和基因序列长度进行统计发现，二者具有相似的序列长度分布规律（图1A；图1B），且不同长度范围内的基因数目均少于转录本数目（图1C）。然而，基因和转录本在序列长度分布统计方面没有明显差别（表1），说明从转录本至基因的序列冗余是均匀分布在不同长度序列上。