《表3 读长与重叠序列注释比较》
测序后共计产生32233976条读长,每条读长序列长度为150 bp,经过接头序列及低质量序列去除后得到31490033条读长。读长序列分析注释后发现共有742196条读长与病毒序列有较高的相似性,占总体读长序列数据的2.36%。重叠序列分析得到415 117条重叠序列,其中307条被注释到病毒基因组包括指环病毒科(Anelloviridae)、沙粒病毒科(Arenaviridae)、星状病毒科(Astroviridae)、环状病毒科(Circoviridae)、冠状病毒科(Coronaviridae)、细小病毒科(Parvoviridae)、小RNA病毒科(Picornaviridae)、痘病毒科(Poxviridae)、Smacoviridae、Genomoviridae、逆转录病毒科(Retroviridae)和副粘病毒科(Paramyxoviridae)等12个病毒科的64种病毒(表3)。从注释结果看,该宏病毒组数据注释到冠状病毒科的多个种属(同源性为70%~100%),其中与猪德尔塔冠状病毒(Porcine deltacoronavirus)的同源性最高(99.775%)。读长序列分析耗时1.5 d,重叠序列分析耗时3.5 d,表明本地化建立的动物病毒宏基因组数据分析平台能够高效的完成宏病毒组数据分析工作。
图表编号 | XD00114065400 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2019.10.01 |
作者 | 史智宾、王靖飞 |
绘制单位 | 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室、中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |