《表5 Motif序列及Pfam注释信息》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《板栗PPO基因家族鉴定及生物信息学分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

使用在线保守结构域预测软件MEME对苹果、马铃薯和板栗3个易褐变物种的23个PPOs基因编码蛋白的保守基序进行分析，并将查找的基序在Pfam网站进行注释（表5）。将6个基序命名为motif 1～motif 6，其中基序1、基序2、基序3和基序5位于酪氨酸中心区，基序4位于多酚氧化酶中间保守域，基序6位于PPO未知功能保守结构域（图5）。每个PPO蛋白序列都含有Tyrosinase、PPO＿DWL和PPO＿KFDV结构域。利用Mega 6.0软件生成系统进化树，采用neighbor-joining(NJ）法，校正参数Bootstrap=1 000，发现板栗和蔷薇科苹果的PPO基因亲缘关系较近，而与茄科马铃薯的PPO基因亲缘关系较远。