《表1 序列组装结果统计表》

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《基于宏转录组学技术解析工业豇豆泡菜发酵过程中活性微生物群落结构变化》

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注:N50/N90长度越长，说明组装拼接效果越好，得到的宏转录组序列越完整；其中，N50长度尤为重要，是衡量宏转录组组装拼接效果好坏的主要指标之一

测序后的原始数据经过质控，得到高质量序列后由Trinity软件进行拼接组装，相应统计结果如表1所示。5个豇豆泡菜样本分别获得183 858、90 693、96 263、48 246和19 955条序列且拼接效果较好。为了比较5个样本的多样性，使用QIIME软件对其计算α多样性指数，结果如表2所示。Chao1指数和ACE指数衡量物种丰度，Shannon指数和Simpson指数衡量物种多样性和均匀度[18]。由表2可知，发酵第1天的Chao1和ACE指数最大，表明发酵第1天的活性菌群丰富度最高，Shannon指数值和Simpson指数值也比较高，表明发酵第1天活性菌群多样性较高，而发酵90 d所有α多样性指数都最低，表明发酵后期活性菌群多样性和丰富度较低，同时也说明在发酵过程中活性微生物群落演替逐渐趋于稳定。