《表2 高质量序列比对到组装的中华蟾蜍转录组上的结果》

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《中华蟾蜍多组织差异转录组分析》

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使用hisat2 v2.1.0将原始测序数据与组装转录本进行比对，每个样本的比对率均高于85.00%，最高的是心脏（89.75%），最低的是右耳后腺（87.60%）（表2）。比对率侧面反映了组装结果的正确性，在从头组装中，越高序列比对率代表了越多的序列参与了转录本的组装。最后使用corest，基于对比结果，使用层次聚类的方法将Trinity组装出来的转录本重新聚类，挑选每个类中最长的序列作为该类的代表，获得Unigene转录组，共计132 117条，用作后续的分析。