《表2 巨菌草转录组组装结果》

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《巨菌草幼叶及根转录组功能基因测序及分析》


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N50:Not less than the total length 50%.N90:Not less than the total length 90%.

通过采用Illumina Hiseq 4000高通量测序技术,对巨菌草幼叶、根组织进行转录组测序,共有144670426条raw reads和141886800条clean reads,总长度分别为21.68和21.28 Gb。对所有样品的转录组clean reads进行无参组装,共得到210806条转录本和150336条unigene。其中最短transcripts为201 bp,最长为14723 bp,平均为760 bp;最短unigene为201 bp,最长为14723 bp,平均unigene为642 bp。巨菌草transcripts和unigene长度分布如表2所示。