《表1 款冬转录组序列组装结果统计》

《表1 款冬转录组序列组装结果统计》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《利用转录组分析款冬萜类化合物生物合成关键酶基因及表达特征》


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利用Trinity软件进行从头组装,花蕾和叶分别获得72 844、50 398个Unigene,花蕾的总长度、N50长度、平均长度分别为44 509 629、1 081、611nt;叶的序列总长度、N50长度、平均长度分别为36 816 804、1 324、731 nt(表1)。根据序列之间的重叠部分,对款冬花蕾和叶的序列进行混合组装,共得到91 118个Unigene,平均长度696 nt,N50为1 327 nt(表1),其中长度在200~300 nt的Unigene最多,达39 353(43.19%)个,其次是300~500 nt的Unigene 19 396个(21.29%),500~1 000 nt的Unigene有13 431个(14.74%),1 000~2 000 nt的Unigene有12 199个(13.39%),长度大于2 000 nt的Unigene为6 739(7.40%)条,款冬Unigene序列长度分布信息详见图1。