《表1 款冬转录组序列组装结果统计》
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《利用转录组分析款冬萜类化合物生物合成关键酶基因及表达特征》
利用Trinity软件进行从头组装,花蕾和叶分别获得72 844、50 398个Unigene,花蕾的总长度、N50长度、平均长度分别为44 509 629、1 081、611nt;叶的序列总长度、N50长度、平均长度分别为36 816 804、1 324、731 nt(表1)。根据序列之间的重叠部分,对款冬花蕾和叶的序列进行混合组装,共得到91 118个Unigene,平均长度696 nt,N50为1 327 nt(表1),其中长度在200~300 nt的Unigene最多,达39 353(43.19%)个,其次是300~500 nt的Unigene 19 396个(21.29%),500~1 000 nt的Unigene有13 431个(14.74%),1 000~2 000 nt的Unigene有12 199个(13.39%),长度大于2 000 nt的Unigene为6 739(7.40%)条,款冬Unigene序列长度分布信息详见图1。
图表编号 | XD00228368100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.28 |
作者 | 贺润丽、王晓英、韩毅丽、刘计权、杜晨晖、王莉花 |
绘制单位 | 山西中医药大学、山西中医药大学、山西中医药大学、山西中医药大学、山西中医药大学、云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室 |
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