《表5 巨菌草幼叶、根下调差异基因GO富集结果》

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《巨菌草幼叶及根转录组功能基因测序及分析》


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注:BP代表生物学过程;MF代表分子功能;CC代表细胞组成.

分别将上调和下调的差异基因进行GO功能富集分析,将FDR<0.05作为显著富集选项,共鉴定到上调基因GO显著富集结果20条,下调基因显著富集结果53条。其中上调的DEGs显著富集的前5个功能主要包括有铜离子结合(copper ion binding),化学刺激反应(response to chemical stimulus),抗氧化活性(antioxidant activity),应对水(response to water),过氧化物酶活性(peroxidase activity)等功能上,其DEGs个数分别为35,73,42,25和38。DEGs富集较多的功能主要在电子传递(electron transport),碳水化合物代谢过程(carbohydrate metabolic process),离子结合(ion binding),阳离子绑定(cation binding),金属离子结合(metal ion binding),每个功能都有超过150个DEGs富集(表4)。下调的DEGs主要集中在生物学过程和分子功能方面,显著富集的前5项主要包括有光合作用、光收获(photosynthesis,light harvesting),光合作用、光反应(photosynthesis,light reaction),电子传递(electron transport),光合作用(photosynthesis)和氧化还原酶活性(oxidoreductase activity)。DEGs富集个数较多的功能是代谢过程(metabolic process)和催化活性(catalytic activity),分别为883和767(表5)。